Serial ini berfokus pada petualangan Arata Kasuga, seorang siswa sekolah menengah, yang menjadi target oleh Lilith, seorang guru di sekolah mistik. Diberikan tiga pilihan dalam upaya untuk membantu menyelamatkan fenomena kehancuran dunia oleh kekuatan jahat dan saat mencoba untuk memecahkan misteri sepupu tercinta dan teman masa kecilnya, Hijiri, yang menghilang ke ruang yang berbeda.